Herrikoa participa en las siguientes comisiones:
. Escolarización: La comisión de escolarización es la encargada de dirigir, supervisar y coordinar la asignación de alumnado a los centros. Se debaten casos que no han sido resueltos en convocatorias ordinarias de escolarización.
Participamos con un representante.
. Becas: La comisión de becas se convoca una sola vez durante el curso escolar y es la encargada de analizar y aprobar las bases de las convocatorias de becas para asegurar que se ajustan a la norma.
Participamos con un representante
. Conciertos Educativos: La función principal de la comisión de conciertos educativos de Navarra es evaluar las solicitudes de nuevos conciertos educativos, renovación o modificación de los existentes.
Participamos con un representante y se suele convocar cuando hay que renovar algún concierto.